Organické a anorganické pigmenty sa rozlišujú na základe ich pôvodu a chemických vlastností.
Zdroj: Organické pigmenty sú extrahované alebo syntetizované zo zvierat, rastlín, minerálov alebo umelo syntetizovaných organických zlúčenín. Anorganické pigmenty sa extrahujú alebo syntetizujú z rúd, minerálov alebo syntetických anorganických zlúčenín.
Chemické vlastnosti: Molekuly organických pigmentov sú zvyčajne zložené zo zložitých štruktúr obsahujúcich uhlík a ich farba je určená chemickou štruktúrou organickej zlúčeniny. Molekuly anorganických pigmentov sú zvyčajne zložené z anorganických prvkov a ich farba je určená vlastnosťami a štruktúrou prvkov.
Stabilita: Anorganické pigmenty sú vo všeobecnosti stabilnejšie ako organické pigmenty a odolnejšie voči svetlu, kyselinám, zásadám a teplu. Organické pigmenty sa môžu za určitých podmienok rozpadnúť alebo zmeniť farbu. Farebný rozsah: Kvôli rozdielom v ich chemickej štruktúre majú organické pigmenty vo všeobecnosti širší rozsah farieb, čo umožňuje živšie farby. Anorganické pigmenty majú relatívne úzky rozsah farieb. Oblasti použitia: Organické pigmenty sú vhodné pre farbivá, farby, plasty, papier a iné oblasti. Anorganické pigmenty sú široko používané v keramike, skle, pigmentoch, náteroch a iných oblastiach.

Je potrebné poznamenať, že organické aj anorganické pigmenty majú svoje výhody a vlastnosti a výber použitého pigmentu závisí od konkrétnych potrieb aplikácie a požadovaného účinku.